寶誠生物助力安徽省阜陽市疾控中心順利完成國內(nèi)第一臺MK1C測序儀裝機(jī)測序
2020-04-29
2020年4月19日至21日，寶誠生物完成了國內(nèi)Nanopore新款測序儀MK1C在安徽省阜陽市疾病預(yù)防控制中心的裝機(jī)任務(wù)。在3月27-28日，我公司就積極響應(yīng)阜陽疾控中心關(guān)于盡快落實測序系統(tǒng)投入疫情防控的要求，提前投入了一臺MinION測序儀，并進(jìn)行了詳細(xì)的實驗和生信分析培訓(xùn)。由于前期已經(jīng)過詳細(xì)的培訓(xùn)，所以本次MK1C的裝機(jī)過程非常順利。在此特別感謝阜陽市疾控中心相領(lǐng)導(dǎo)、檢驗科卜科長、郭老師、張老師等對我們工作的支持。看到他們?yōu)榱艘咔榉揽刈汾s工作進(jìn)度，檢驗科的老師吃住在單位，做到樣本隨到隨做，這種忘我的實干精神深深感染了我們，我司技術(shù)支持也臨時調(diào)整優(yōu)化了安裝培訓(xùn)方案，進(jìn)行穿插式培訓(xùn)，每天與客戶一起工作到凌晨1點多，得到了用戶的充分肯定與好評。在本次裝機(jī)培訓(xùn)中心，阜陽疾控中心應(yīng)用科技K0212新冠全基因組捕獲試劑盒進(jìn)行新冠病毒的全基因組捕獲，SQK-LSK109 1D試劑盒連接法文庫構(gòu)建，成功完成了對新冠病毒樣本的全基因組測序并上傳BIGD國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)庫，基因組覆蓋度超過99.5%，為戰(zhàn)疫推進(jìn)做出自己的貢獻(xiàn)。實驗結(jié)束之后老師表示Oxford Nanopore的MK1C測序儀的便攜與實時性，該設(shè)備的投入使用，能大大加強(qiáng)他們對于本次新冠疫情的變異分析及溯源工作，同時對于常規(guī)檢測無法確定的未知微生物致病源，可以很好地解決這個問題，提供很多檢測方向的思路，鑒于目前的檢測結(jié)果非常令人滿意，他們表示馬上開始下一批次樣本的實驗檢測。Nanopore測序具有實時性、長讀長的特點，目前實際操作中讀取的最長DNA片段長度大于2Mb。此外，nanopore可以直接測序DNA和RNA，不需要PCR擴(kuò)增，使得測序無擴(kuò)增偏差。而nanopore的文庫制備簡單，測序儀便攜，可以攜帶至現(xiàn)場進(jìn)行測序等特點，真正意義上做到了使任何人在任何地點都可以進(jìn)行測序這樣的理念。Oxford Nanopore是一家技術(shù)型公司，公司針對通量大小推出以下測序產(chǎn)品，分別是：Flongle，MinION, MinIONMK1C，GridION和 PromethION. 公司注重技術(shù)的開發(fā)，現(xiàn)有員工300余人，涉及多重學(xué)科和領(lǐng)域。針對不同的應(yīng)用領(lǐng)域，Nanopore有不同的指導(dǎo)方案。現(xiàn)階段，Nanopore測序儀在微生物耐病毒耐藥性及致病性，環(huán)境研究，植物研究，癌癥研究，臨床研究，微生物組，轉(zhuǎn)錄組分析等領(lǐng)域都有大量的應(yīng)...[+查看詳情]
